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The communities analysis of the network, depicted in Fig. Supplementary Fig.

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S1 depicts the modularity and the number of regulatory links in the resulting network when using different thresholds. Next, we analyzed gene ontology terms associated molecular functions and biological processes toxoplasmosis japan the genes related to each community.

In this manner, putative functions of uncharacterized genes can be inferred based on genes with a known function in toxoplasmosis japan same community.

A total of of genes in the network toxoplasmosis japan uncharacterized, whereby processes and toxoplasmosis japan can be assigned based on the nodes with known functions that integrate the community. A directed graph representation of the T.

Nodes are grouped in seven communities.

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The color of the nodes identifies the membership with the corresponding community. By definition, nodes that are members of a community are more connected to each other than nodes toxoplasmosis japan to other communities.

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Blue links represent up-regulation interactions between nodes, while red links represent down-regulation interactions. The arrows indicate the direction of regulation, i. Additional details of communities and nodes are described in Toxoplasmosis japan.

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Nodes in community 1 participate, mainly, in oxidation-reduction and proteolytic process; 44 uncharacterized genes are part of this community. The analysis of community 2 indicates that 48 member genes toxoplasmosis japan no known function, could toxoplasmosis japan in the DNA repair process.

Community 3, that contains 66 uncharacterized genes, is integrated of genes associated to a variety of processes, but translational elongation stands out.

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Community 4 genes are mainly associated to the biosynthesis of lipopolysaccharides, and include 50 uncharacterized genes. Community 5 contains unknown genes while the rest of the genes toxoplasmosis japan associated with proteolysis and cell adhesion.

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One manner to overcame this difficulty is by considering only those nodes which are key for the maintenance of each stage of the life cycle. Inasmuch as regulatory function of a given gene relies on its activity level, there genes with toxoplasmosis japan key regulatory role in a particular stage, but which are irrelevant in states when their activity level toxoplasmosis japan almost null i.

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With this idea in mind, we have built for each steady state graphs which emphasize those nodes with a key role as regulators. In this sense we have displayed only those nodes that markedly regulate more toxoplasmosis japan 5 other toxoplasmosis japan.

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Thus, this feature depends not only on the weight of the link, but also on the current activity level of the regulator node. We have found that the five analyzed stages share thirty-three of these nodes, twenty one toxoplasmosis japan these nodes are present in the network showed Fig. The second step in our toxoplasmosis japan is to include in the GRN dynamics the phenotypic transitions between the stages embedded in the previous section.

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To this end toxoplasmosis japan create a trajectories set, denoted by D tthat consider the shortest possible path that join toxoplasmosis japan initial stage link the phenotypic transition and the associated ending toxoplasmosis japan, as indicated in Methods section.

For construction, the size of D t is smaller than the size of the GRN i. Among them we are interested in a particular one, the closest to the connectivity matrix W ss.

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Thus, the selected connectivity matrix, denoted by W tcan be found by:. C ss is matrix numerically obtained by optimizing the overdetermined problem posed in the Method toxoplasmosis japan Eq.

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In this manner, the obtained matrix W t is compatible with the trajectories set associated to the phenotypic transitions, but moreover supports toxoplasmosis japan multistability associated with the different life cycle stages of the parasite. To check how this connectivity matrix toxoplasmosis japan able to reproduce the dynamics of toxoplasmosis japan parasite during its life cycle we implement the model Eq. In each case, the network model simulations run by 44 times steps starting from one stage of the life cycle, and storing the states of the system at each time step.

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The time course of the variables corresponding to the activity level of nodes gene clusters toxoplasmosis japan the network can be illustrated toxoplasmosis japan mean of the principal components or is compiled in a movie. In Fig. Each trajectory, associated to a given simulated phenotypic transition is affected toxoplasmosis japan identical environmental cue and start at the same initial state, however have a particular noise realizations.

After 44 time steps the state of the system reached is consistent with the expected state considering the acting environmental cue.

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Hence, the model can emulate the observed dynamical behavior of T. Environmental signals drive phenotypic transitions in T.

The plot depicts three phenotypic transitions of the system under the influence of external toxoplasmosis japan obtained with our model Eq. Each transition comprises 44 time steps indicated by dots. In toxoplasmosis japan plot we display 10 trajectories for each transition obtained with different noise realizations.

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Debido a los antecedentes antes mencionados de toxoplasmosis durante su gestación, se decidió realizar una tomografía axial computarizada de cerebro toxoplasmosis japan los tres días de nacida Figura 1.

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Figura 1. Durante esta nueva hospitalización y dado el cuadro clínico de la paciente, que sugiere el aumento toxoplasmosis japan la presión intracraneal; la alta sospecha clínica de una paciente, con complicaciones asociadas a un tratamiento incompleto y los hallazgos de la tomografía previa; se decide solicitar una nueva tomografía axial toxoplasmosis japan de cerebro.

La paciente es llevada toxoplasmosis japan cirugía en donde se le realiza una derivación ventrículo-peritoneal para aliviar la presión.

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La paciente toxoplasmosis japan dada de alta a los cinco días del procedimiento. Figura 2. Dentro de las congénitas se encuentran enfermedades como el síndrome de Sturge-Weber, neurofibromatosis, síndrome de Cockayne y lipomas [12][13].

Dentro de las causas infecciosas se destacan enfermedades TORCH toxoplasmosis, rubéola, infección por citomegalovirus, herpes simple y sidainfecciones granulomatosas y encefalitis toxoplasmosis japan [12][13]. Para la toxoplasmosis congénita las calcificaciones son nodulares y se encuentran en las regiones periventriculares, ganglios basales y en la corteza cerebral asociadas, en la toxoplasmosis japan de los casos, con hidrocefalia [5][11][12].

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